A templomhoz tartozó minorita kolostor 1950-ben az állam kezébe került, kivéve öt szerzetesi szobát, amely ez idáig plébániaként működött. A kolostor épületét jelenleg megyei fenntartású múzeumként tartják számon. Babály András plébános elmondta, a rend a meghagyott szerzetesi szobákról is lemondott, és az állam kárpótlási összegként összesen 140 millió forintot fizet, 2007 óta részletekben. Minorita szerzetesek 2002 óta nem tartózkodnak Nyírbátorban, ezért a debrecen-nyíregyházi egyházmegye harminc évre megkapta a plébánia működtetését. A rend a kárpótlási összeget továbbítja az egyházközség számlájára, amit az építkezésre fordítanak, többek között a közösségi ház kialakítására. Itt működik majd a plébánia, az emeleti részen pedig kolostort alakítanak ki. Emellett egy rendezvényudvart is építenek, bekapcsolódva ezzel a város zenei, kulturális életébe. A debrecen-nyíregyházi egyházmegye tízmillió forinttal támogatja a beruházást. A minoriták bíznak benne, hogy a rend megerősödésével idővel visszatérhetnek Nyírbátorba.
A felújítási munkálatok miatt a templom – előreláthatólag az év végéig – zárva lesz, nem látogatható.