A kispapévek után 1928-ban szentelték fel Werner Alajost, akit főpásztora Rómába küldött tanulni a Gregoriana Egyetem egyházzenei tanszékére, ahonnan első magyarként tért haza musica sacra diplomával. Közben teológiai doktorátusát is megszerezte. Itthon kórust szervezett – a Schola Cantorum Sabariensist. A száz tagból álló együttes országosan hamarosan ismert lett, nemzetközi hírnévre az 1938-as Eucharisztikus Világkongresszuson való szereplésük után tettek szert. Werner Alajos tanított a Zeneakadémián, együtt dolgozott Bárdos Lajossal és Kodály Zoltánnal, akinek gyóntatója is volt. 1948-ban a Regnum Marianum Hitoktatóközpont házfőnöke lett. Egy esztendővel később tanári állását elvesztette, és Máriaremetére került káplánnak és kántornak. Rövid időn belül olyan gyerekkórust hozott létre, amelynek énekéért messziről is jöttek az emberek, hogy hallhassák. Regnumi munkáját sem adta fel – melyért hatvannyolc paptársával 1960-ban letartóztatták. Öt év börtönre ítélték, 1963-ban kiengedték, Celldömölkre helyezték, ahol ismét fiatalokból álló kórust szervezett. 1964-ben ismét letartóztatták, csak 1967-ben szabadult. A börtönben sem tagadta meg önmagát: kórust szervezett a rabokból és őrökből. Máriaremetére ment ismét, Budapestet nem hagyhatta el. Aranymiséje után nem sokkal, 1978-ban hunyt el. Előbb a Farkasréti temetőbe, majd a remetei kegytemplom mellé temették a plébánia kertjébe. Takács Nándor püspök homíliája második részében Werner Alajosról beszélt. Kiemelte zenei tehetségét, szerénységét, imádságos lelkületét, önfeláldozását, hűségét. A kiállítás megnyitásakor Esterházy László plébános szólt a tárlat születésének körülményeiről. Megtudhattuk, hogy a plébánia területén élő egyik családnál tett látogatása alkalmával egy reverendát látott, melyről kiderült, hogy Werner Alajosé volt (aki egyébként mindig reverendában járt, más ruhája alig volt, hiszen minden pénzéből a rászorulókat segítette), s így született a kiállítás ötlete, melyet mostantól minden Máriaremetére érkező zarándok megtekinthet a templom melletti folyosón. Tárgyakon, dokumentumokon keresztül ismerhetik meg az érdeklődők a templom egykori hűséges papját, a hazai egyház és az egyházi zene e jeles képviselőjét.
